小便总感觉尿不干净，可能的原因有以下几方面：
一、泌尿系统感染，这时可以出现膀胱黏膜充血、水肿、敏感性升高等改变。少许尿液就可以刺激患者出现有尿意，故而患者出现反复的排尿，总觉得有尿没有排干净。同时可伴有排尿的异常，如尿急、尿痛或者腰痛、小腹部疼痛等症状。需要进行尿常规和尿培养检查，待进一步确诊有无尿路感染存在。
二、男性年龄超过45周岁，出现尿不尽感，则要考虑是否患有前列腺增生症。当腺体增生突向尿道腔和膀胱腔，出现尿道内阻力增大、尿道管腔变细。这样膀胱排空时部分尿液被排出体外，部分尿液残留在膀胱之内，就会出现尿不尽感。同时伴有排尿费力或者排尿分叉、排尿无力等症状。需要进行前列腺的B超检查，来进一步的确诊。