硝普钠的副作用是导致严重低血压，引起冠状动脉和脑血管灌注不足产生严重后果。
硝普钠其他副作用主要来自于其代谢产物，氰化物和硫氰酸盐，氰化物是硝普钠的中间代谢产物，如过量或超量使用，可出现运动失调、视力模糊。
氰化物在体内蓄积，导致组织缺血、缺氧、代谢性酸中毒及死亡，特别是肾功能减退的患者。
硫氰酸盐是硝普钠的最终代谢产物，小剂量长期用药就会出现硫氰酸盐中毒，表现为甲状腺功能低下、头痛、食欲不振、恶心、呕吐及无力，并发展为昏迷及死亡。