胰岛素的副作用主要包括低血糖、继发性高脂血症以及其他疾病。长期注射胰岛素，一般情况下不会对人体产生副作用，但是针对个别患者也会出现副作用。临床上最常见的副作用是因为注射胰岛素不符合要求，从而导致身体中血药浓度升高导致低血糖，一般补充能量即可缓解症状。
除此之外，胰岛素是一种人工合成的激素，长期注射也容易引发继发性肥胖或者高脂血症，需要针对临床症状进行适当调整，例如运动调整，生活饮食习惯等等。也可能会对人体自身的胰岛造成影响引起胰岛敏感下降，出现这种情况之后，即使注射胰岛素身体血糖也不会下降，需要选择其他的治疗方式。