对于夜班族，长期处于非自然灯光下容易出现视力疲劳，尤其是夜班时常对着监视器、显示屏工作，对眼睛的伤害就更大。夜班还可能影响消化系统，因为夜班让饮食习惯发生变化，白天睡觉晚上加班，饿了就吃点简单的泡面，长期下去对胃肠不利。为了提神有人还喜欢喝咖啡和吃刺激性食物，就容易导致消化不良、慢性胃炎等。上夜班的人还会影响睡眠质量，虽然白天和黑夜的长基本一样，但是白天环境嘈杂而夜晚安静，在白天睡觉也很容易受到家人的干扰，长期上夜班会造成记忆力减退、反应迟钝、情绪波动等。
另外，长期上夜班还会引起激素水平的紊乱，激素失调引起免疫力减退，患病的几率增加容易出现感冒、口腔溃疡等。长期上夜班睡眠不足，也是患高血压的致病因素，心血管疾病和睡眠障碍也有关系，上夜班经常吸烟的人不在少数，这类人容易出现血管痉挛，出现心肌梗死。经常上夜班不利于运动系统的健康，上夜班的人长久坐，白天为了补觉也不出门，晒不到太阳也不爱运动，容易导致骨质疏松。