针对于三个月宝宝咳嗽、流鼻涕的症状，可以采用以下措施处理：
首先，可以应用美芬那敏铵，其成分主要包括马来酸氯苯那敏等，可以起到良好的改善流鼻涕的作用。
其次，由于儿童患有急性鼻炎引起的症状，此时需要给儿童应用孟鲁司特、氯雷他定等治疗。
此外，可以应用按摩的方法处理，可以按揉鼻通穴。
鼻通穴位于儿童鼻翼与鼻软骨的交界处，可以用大拇指按揉儿童的鼻通穴，从而也能起到缓解鼻塞、咳嗽的效果。