混合型结缔组织疾病患者可有多器官受累，表现出系统性硬化症、系统性红斑狼疮或类风湿关节炎的部分症状。与抗UIRNP抗体相关的临床表现有肿胀手、关节炎、雷诺现象等，肺部病变、食管蠕动减弱也是本病的特征性表现。
一、典型症状
1、风湿病表现：关节疼痛和发僵以掌指关节受累较多见，X线可见关节侵蚀和破坏。皮肤、黏膜病变，最常见及最早的表现是雷诺现象和手指弥漫性肿胀。肌痛、肌无力，伴有炎性肌病的混合性结缔组织病患者可以出现高热。
2、肺部受累表现：可出现干咳、呼吸困难、胸膜炎性胸痛、间质性肺病、肺功能异常，部分患者可发展为严重的肺纤维化。肺动脉高压是主要的并发症，也是死亡原因。
3、心脏受累表现表现：心脏全层均可累及，可有心肌炎症细胞浸润及冠状动脉增生性病变，心肌受累、右心室肥厚常继发于肺动脉高压。
4、肾脏系统受累表现：通常为系膜性肾小球肾炎，膜性肾小球肾炎及肾病综合征，可出现肾血管性高压危象。
5、消化系统受累表现：部分患者出现食管运动功能异常，括约肌压力降低，蠕动减弱，吞咽困难，消化道受累可有巨结肠、肠蠕动减退、腹腔出血、胰腺炎、腹水等表现。
6、神经系统受累表现：最常见神经系统病变为三叉神经病变，血管性头痛常见，部分患者出现无菌性脑膜炎。
7、血液系统受累表现：可有贫血、白细胞数减少、血小板减少，血小板减少性紫癜。
二、伴随症状
伴有脱发、色素减退、光敏感、面部毛细血管扩张和甲周红斑等，部分患者可有皮肌炎的典型皮肤改变。