脑神经痛首先要查明造成脑神经痛的原因，多数情况下是由于中枢神经系统疾病，导致出现的脑神经痛，比如颅脑外伤导致出现的颅骨骨折、颅内出血、颅内血肿，包括有脑血管病引起的自发性高血压性脑出血、蛛网膜下腔出血、动脉瘤、动脉畸形等引起脑神经痛。这些需要做头颅核磁和头颅血管核磁来明确这些病因，查明病因以后进行对症治疗，最主要的进行开颅治疗或者介入治疗，也可以暂时性的口服镇痛药物来进行治疗，同时也可以用甘露醇、脱水降颅压缓解疼痛。
另外一部分还有脑神经疼，还有一部分叫神经病理性疼痛，如三叉神经、舌咽神经、枕神经痛等，这部分可以排除颅内占位性病变以后，可以暂时性口服卡马西平类或者加巴喷丁、普瑞巴林来缓解疼痛，必要时候可以做开颅手术或微创的射频手术。另外还有继发性的带状疱疹后脑神经痛，我们需要做神经阻滞，以及口服药物营养神经治疗。另外一种就是颈椎源性的脑神经痛，这部分需要做颈椎核磁共振检查以后，进行相关治疗缓解疼痛。