宝宝三个月体检项目包括下列几个方面，测量宝宝的身长、体重、头围、胸围和腹围，然后要进行全面的身体检查，包括神经系统检查、各种反射情况，还有心、肺、肝、脾、四肢、皮肤，以及眼、耳、口腔、淋巴结，还有听力和视力是否筛查过关，还有看孩子囟门，后囟基本上闭合，前囟是否平坦，囟门是否增大，有没有枕秃、佝偻病的体征。
另外，询问宝宝的预防情况、喂养情况、睡眠和户外活动的情况，还有精神上面的发育，要进行采血化验，做血红蛋白的测定，然后进行钙、磷、碱性磷酸酶、锌、铁等微量元素的测定，之后建议按照一定时间来定期检查，术后第一年最好每三个月检查一次，即生后3、6、9、12个月，生后第2-3年，每六个月检查一次，三岁以上的儿童每年检查一次比较不错，有问题及时发现并纠正。