王氏保赤丸用药的时间应该在医生的指导下，由医生决定用药剂量以及服用时间。
王氏保赤丸是中成药，是由黄连、大黄等多味药材制成小的丸剂，具有健脾、祛痰的功效，多用于小孩脾胃相关的症状，如乳治、痰积、大便秘结等，对于成人的胃肠不清也有一定的疗效。中成药区别与西药的地方就在于缺乏临床的实验性证据，无法证明其有效性和安全性，一般都是在中医理论的指导下结合患者具体情况来辨证施治。一般轻症1次/天，重症2次/天，具体用法要在医生的指导下进行。患者需要注意用药前看说明书，了解用法、用量以及相关的注意事项。中成药通常注意事项等信息较缺乏，尚不明确，但不等于没有，所以用药的时候还应该注意，用药期间发生一些较严重的症状或症状加重、其它症状的出现，应及时的停药到医院就诊。
对于乳儿患者，可将药丸附着于乳头上，然后哺乳时药丸与乳汁一同吃下，对于成年人正常口服即可。