龟头上有小疱，建议到医院进一步检查明确具体的原因。1、如果机械性的摩擦或者化学性的刺激等，可以产生小疱，伴有局部的疼痛、红肿的改变。常见于手淫或者使用酒精来擦拭龟头，都可以出现有小疱样的改变。2、如果出现龟头炎，也可以出现龟头上的小疱，比如细菌感染、真菌感染都可以出现小疱样的改变，伴有龟头局部的红肿、包皮红肿或者局部疼痛的症状，需要进一步进行相关的分泌物涂片检查来进行确诊。3、疱疹病毒感染可以出现龟头小疱，小疱体积较小呈簇状分布，伴有局部发红或者伴有局部疼痛的症状。疱壁可以自行破裂，破裂后形成局部的糜烂面，伴有明显的疼痛感。属于一种性传播的疾病，大多是通过不洁的性接触而导致疱疹病毒感染，需要进一步进行疱疹病毒的检测来临床确诊。