肛门老是擦不干净，常见的原因有痔疮或者肛瘘。痔疮是因为直肠末端、肛周黏膜下静脉丛发生迂曲形成曲张的静脉团，长期患痔疮会引起不良的反应，比如肛门脱出、便秘、坠胀感以及大便总是查不干净等表现，出现了痔疮可以通过内镜检查明确诊断，必要时可以给予药物或者手术治疗的方式来处理痔疮。
肛瘘是因为肛门直肠脓肿破溃或者切开排脓后形成，脓肿逐渐缩小，但肠内容物内容物仍然不断的进入脓腔，在愈合的过程中形成迂曲的腔道，由于引流不畅、不愈合，时间长之后会形成瘘管，可以导致经常有肠道内容物顺着瘘管排到肛周，表现为肛门老是擦不干净的现象。出现肛瘘，可以通过外科手术和瘘管挂线疗法的方式来处理肛瘘。