反流性食管炎的治疗包括一般治疗跟药物治疗，所谓的一般治疗就包括改善生活方式以及饮食习惯，在生活中应该戒烟、戒酒，晚餐不要安排得太晚，应该睡前1-2个小时不要再吃东西了，而且如果晚上的时候反流非常严重的话，可以床头抬高来预防反流。
并且体重的控制是非常重要的，肥胖者过量的体重和脂肪不仅会托压迫食管跟胃部，导致胃酸的逆流，所以要注意适当的运动以及必要的减肥。如果上述的生活方式和饮食还不能改善的话，应该进行药物的治疗，药物的治疗主要包括抑制胃酸的药以及促胃动力药。抑制胃酸的药最常用的就是质子泵抑制剂，包括奥美拉唑、雷贝拉唑、泮托拉唑等，还有H2受体阻滞剂，也是一种抑酸药，包括法莫替丁、雷尼替丁等，但是H2受体的阻滞剂比较质子泵抑制剂的作用相对会减少一些。还应该加用促动力药，促进胃正常的蠕动，从而增加食道下括约肌的压力，来改善胃食管反流的症状，最常用的就是多潘立酮、莫沙必利、伊托必利等。