正常情况下，用MTX后14天患者血中的人绒毛膜促性腺激素下降，并连续3次阴性提示治疗成功，HCG下降到完全正常的水平，一般需要3-4周的时间。
使用MTX治疗宫外孕主要的机制是抑制滋养细胞增生，破坏绒毛使胚胎组织坏死、脱落、吸收。治疗的方案比较多，常用是0.4mg/kg，每天肌肉注射，5天1个疗程；单次肌肉注射50mg/m^2，在治疗的第4天和第7天测血中的人绒毛膜促性腺激素的水平。如果治疗后4-7天血中的人绒毛膜促性腺激素下降<15%，则应该重复治疗，每周监测血中的人绒毛膜促性腺激素的水平，直到绒毛膜促性腺激素降至5U/L，一般需要3-4周的时间。
MTX属于化疗药物，注射之后会有副作用表现出来，患者可能会出现恶心、呕吐、腰痛、小腹部坠胀、肛门部位坠胀的感觉，属于用药期间要忌口，吃清淡、易消化的食物，保证营养摄入。