半夜出现腹部疼痛并且痛醒，有可能是十二指肠溃疡，也有可能是高胃酸型的胃溃疡引起。因为在半夜的时候，患者胃内的食物已经排空，导致胃内以及十二指肠内的胃酸的浓度比较高，酸性环境下会引起十二指肠溃疡明显的疼痛，或者高胃酸性的胃溃疡也可以表现为明显的疼痛，疼痛的性质比较剧烈，通常患者能够痛醒。
需要行胃镜检查来进一步的明确，如果诊断之后，需要口服药物治疗，包括奥美拉唑或者雷贝拉唑、克拉霉素、阿莫西林等，要治疗两周左右。如果十二指肠溃疡治疗的周期可能在一个月左右，在治疗之后要进一步的用胃镜检查来复查，来了解溃疡有没有治愈。
如果不治疗之后，溃疡时间长了，有可能形成穿孔，表现为弥漫性的腹膜炎，或者胃内出现大出血。