卵巢囊性暗区可以分为生理性，也可以分为病理性。卵巢囊性暗区如果是生理性，大多见于卵巢内卵泡的发育或者黄体的发育。卵巢暗囊性暗区如果病理性，有可能是卵巢肿瘤的囊性变，也就是卵巢囊肿。
卵巢生理性的囊性暗区主要指的是卵巢内的卵泡发育，女性每个月在月经的第5-7天，卵巢内都会有一批卵泡发育，但是只有一个卵泡会成为优势卵泡，长的最快。随着卵泡的长大，在B超下可以看到卵巢内有囊性暗区，但卵泡长到18-22mm的时候，成为成熟卵泡，可以排出卵子。成熟卵泡排出卵子以后，剩余的卵泡结构在卵巢内包裹起来，会形成黄体，黄体继续增大。随着黄体的增大，在卵巢内有可能看到卵巢内的囊性暗区，这个时候是黄体囊肿的存在。如果精子和卵子没有结合，没有受孕，黄体发育到一定程度以后，在排卵后的第9-10天，黄体会迅速萎缩，所以2-3个月以后复查B超，黄体囊肿就会消失。