用于治疗睑板腺囊肿的眼药水有左氧氟沙星滴眼液、加替沙星滴眼液、氧氟沙星滴眼液、妥布霉素滴眼液、双氯芬酸钠滴眼液、鱼腥草滴眼液，但只需其中一种即可，每日4-6次点眼。晚上睡前涂抹抗生素眼膏，比如红霉素眼膏、复方妥布霉素眼膏即可。小而无症状的睑板腺囊肿无需治疗，可以待其自行吸收，大者还可以辅以热敷或向囊肿内注射糖皮质激素来促进吸收。如果采用上述办法还不能消退，应该在局部麻醉下行手术切除，将囊肿内容物刮除干净，剪除、分离后部的囊壁以防复发。