支原体尿路感染最常见的后遗症是如果没有及时治疗，有可能侵犯附睾引起急性附睾炎、睾丸炎，也可能导致男性不育症发生。
所以对于支原体尿路感染，建议大家如果发现后有症状。它的典型症状主要是尿道有刺痒、尿痛、白色的稀薄分泌液，有时发现尿道口可能有痂膜封口的现象，或者内裤有污物，如果发现这些症状，早期检查可以进行有效的确诊。
治疗建议口服米诺环素、红霉素，配偶应该同时进行治疗，通过这样的治疗绝大多数都可以达到有效治愈，长期不及时治疗可能会导致后遗症的出现。