头部CT和头部的核磁共振是临床上常用的检查头部疾病的影像学检查方法，它们的区别主要有以下几点：
1、两者的成像原理不同，CT利用的是放射线进行检查，可以对头部进行断层扫描，而核磁共振利用的是外加磁场，可以对头部进行横断面、矢状面以及冠状面等多断面的扫描。
2、价格不同，头部CT的价格相对比较便宜，一般在100元左右，而头部核磁共振的价格相对比较高，一般在400元左右。
3、对身体的影响不同，CT利用的是放射线，所以对人体有一定的损伤，而核磁共振利用的是外加磁场，对人体并没有什么副作用。
4、检查的侧重点不同，CT对密度的分辨率比较高，所以对诊断脑部出血性疾病的准确率比较高，而核磁共振对软组织的分辨率比较高，所以对脑梗塞以及脑部的肿瘤性病变它的分辨率比较高。