药流孕囊最晚两天排出，药物流产之后胚胎一般会在当天排出，如果第一天没有排出，可以第二天继续用药，观察胚胎是否排出。如果发现阴道流血比较多，伴有大量的血块，要注意胚胎可能已经排出，正常的绒毛组织颜色比较浅。另外，绒毛组织漂浮在水中，能够很明显的和血块进行区分。
胚胎娩出之后，要注意是否和停经的天数相符合，如果小于停经的天数，需要及时复查盆腔三维彩超，注意宫腔内是否有残留，如果有残留需要再做清宫手术，避免残留物在宫腔内停留，否则容易导致患者出现发烧和阴道流血增多。药物流产之后，建议患者口服抗生素预防感染，一般可以口服2-3天，要注意体温是否升高。