上呼吸道感染的原因主要是以病毒感染为主，很多病毒都可以引起上呼吸道感染，比如鼻病毒、腺病毒、呼吸道合胞病毒、柯萨奇病毒。
有少部分上呼吸道感染是由细菌感染所导致的，如溶血性链球菌、肺炎链球菌以及流感嗜血杆菌，也会引起上呼吸道感染。
对于上呼吸道感染，如果考虑以病毒感染为主，通常是通过对症治疗的方法，口服有抗病毒作用的中成药，如蒲地蓝口服液、小柴胡，症状通常会得到缓解。
如果考虑以细菌感染为主，通常是要口服消炎药物，如头孢类、青霉素类的，5-7天症状也会得到明显的缓解。