生殖器有小水疱考虑感染单纯疱疹Ⅱ型病毒引起的生殖器疱疹可能性比较大，主要是由于不洁的性生活导致的。在治疗上可以口服盐酸伐昔洛韦颗粒，外用阿昔洛韦软膏。此病属于自限性疾病，往往不治疗也可以干涸、结痂、脱落，临床自愈，但是极容易复发。
所以在日常生活中，要避免与患有此病的性伙伴进行性接触，以免交叉感染，反复不愈。同时在治疗期间需要忌酒，要提高机体的免疫能力，避免熬夜，心情抑郁、焦虑、生气等引起的机体免疫下降，再复发此病。