轻度的不典型增生，女性患者可以通过给予保妇康栓进行治疗，如果是鳞状上皮不典型增生出现中度或者重度的不典型增生，则多数是由于发生了子宫颈的病变。女性的年龄较轻、有生育要求，可以先给予药物治疗或者给予宫颈的锥切手术治疗。
如果女性患者年龄较大出现了鳞状上皮不典型重度增生的情况，最好给予手术治疗，以选择宫颈的锥切手术或者全切进行治疗。鳞状上皮不典型增生是鳞状上皮的恶变倾向，轻度不典型增生有50%的可能会转变为正常，增生较严重并且不加以干预，很容易会导致宫颈癌变的情况发生。