新生儿肚脐出现肉芽以后，要根据情况进行处理，有时需要局部消毒，有时需要手术切除，具体如下：
第一、局部消毒：如果肚脐肉芽是脐茸或者脐部息肉，孩子没有任何症状，并且肉芽又比较小，可以使用硝酸银溶液对局部进行消毒治疗，一段时间后就会恢复正常。
第二、手术切除：如果肉芽比较大，并且占的面积也比较大，那么就需要进行外科手术切除，再做病理检查来明确诊断。
总而言之，如果新生儿肚脐有肉芽，一般要到正规医院进行治疗。