静脉曲张手术的危害性极低，任何手术都是有一定风险的，但是对于静脉曲张来说风险性相对很小，因为静脉曲张只是针对皮下浅静脉的手术，而且对于手术器官和组织影响都不是很大。特别是近些年采用了静脉曲张的微创手术，手术风险进一步降低，很多患者可以在手术后即可以步行回家，因此现在很多医院开展了日间手术间，同时静脉曲张手术恢复也较快。
很多医院还在进行传统的大隐静脉高位结扎剥脱术，这种术式手术创伤相对较大、手术切口较多，可能会存在着切口感染、延迟愈合等问题。同时高位结扎剥脱术会将大隐静脉主干完整剥脱体外，因此残留的隧道可能会有出血、渗血的一些表现，而时间推移以后会造成局部浅静脉炎的表现。大隐静脉的传统手术可能会造成小腿皮神经的损伤，而造成小腿皮肤麻木的感觉，但是大部分静脉曲张手术危害性还是很小的。