发烧好了以后开始咳嗽，有可能是以下原因引起：
1、有可能是疾病没有完全恢复，进一步加重，可能是肺炎、支气管肺炎，这时候建议完善胸部影像学检查及其他检查，例如胸部X光片、胸部CT、血常规C反应蛋白、肺炎支原体抗体，对症用药治疗，临床上常用头孢类或者大环类脂抗生素抗感染治疗。
2、有可能是再次感染病毒、细菌或者受凉，建议注意清淡饮食，经常开窗通风，不要吸烟，避免煎炸、油腻等食物，必要的时候及时就诊，明确病因，及时用药治疗。