同房肚子疼和怀孕没有太大的关系，同房肚子疼和其它问题可能有关系，像子宫内膜异位症的患者，因为子宫内膜没有正常的在子宫腔内，而是长在卵巢、后穹窿窝里。
同房的时候可能会碰到这些部位，出现下腹部疼痛甚至疼痛的比较厉害等情况，和怀孕没关系。妊娠早期同房比较剧烈可能会引起流产，但不会引起腹痛，这是两回事。
怀孕后在正常情况下也会隐约感到不舒服，原因是子宫长大导致周围韧带受到牵拉，神经在这些韧带里的走形也会受到牵拉，所以会出现下腹不舒服的感觉，这是正常的。如果同房后每次都会有腹痛的情况，建议到医院检查以确定具体原因。