对于细菌性阴道炎，治疗时主要是给予抗厌氧菌的药物，主要有甲硝唑、替硝唑、克林霉素。由于甲硝唑可以抑制厌氧菌的生长，而不影响乳杆菌生长，是比较理想的治疗药物，可以选择全身或局部用药。全身用药首选甲硝唑，至于具体用药剂量，要根据患者的病情，由医生制定适合患者的用药方式。局部用药可以选择甲硝唑制剂进行使用，也可以选择克林霉素软膏进行阴道涂抹，哺乳期患者选择局部用药更加合适。
细菌性阴道炎的临床表现主要为带有鱼腥臭味、稀薄的阴道分泌物增多，可伴有轻度外阴瘙痒或烧灼感，性交后症状会加重，分泌物呈鱼腥臭味，主要是厌氧菌产生的胺类物质所致，检查阴道黏膜没有明显的充血等炎症表现，分泌物呈灰白色、均匀一致、稀薄状，常黏附于阴道壁，但容易从阴道壁擦去，确诊需要进行阴道分泌物的检查，若阴道分泌物中发现线索细胞，即可确诊。