支原体和衣原体是能够引起人类发病的病原微生物，支原体能够独立生活，可以自己繁殖，所以不需要寄生在人体的细胞里面。而衣原体没有能量供应，需要依赖人的细胞提供给能量，所以必须寄生在人的细胞内才能繁殖。
对于人类能够致病的支原体，现在有六种，是肺炎支原体、人型支原体、生殖道支原体、隐匿支原体、发酵支原体和解脲支原体。肺炎支原体是相对来说最常见的，主要引起咽炎、气管炎、支气管炎或者肺炎，发病率相对来说比较高，引起支气管肺炎，主要表现为刺激性干咳，儿童的发生率相对来说比成人更高，是临床上可以彻底治愈的疾病。
其他的支原体，比如解脲支原体，主要是引起泌尿生殖道的感染，其他的人型支原体以及生殖道支原体也主要是引起泌尿生殖道的感染。男性表现为尿道炎，女性表现为泌尿系的感染、阴道炎或者盆腔炎。对于发酵支原体，它可以引起全身的感染，可以引起肺炎、败血症等等，可以是比较重的感染。对于衣原体，现在主要对人类致病的有三种，肺炎衣原体、沙眼衣原体以及鹦鹉热衣原体，肺炎衣原体主要引起人的肺部感染，沙眼衣原体主要引起人的沙眼、结膜炎，同时也可以引起尿道炎，也属于性病的一种病原体。鹦鹉热衣原体主要接触鸟类感染，可以引起肺炎，也可以引起败血症等全身感染。
