淋病的病原菌是淋球菌，也叫淋病奈瑟氏菌。淋球菌的适宜生长条件是35-36℃，含有2.5%-5%二氧化碳的环境中，淋球菌离开人体后不易生长，对理化因子的抵抗力比较弱。
在42℃的环境下，淋球菌可以存活15分钟，在50℃的环境下可以存活五分钟，在100℃的环境中可以立即死亡，在完全干燥的情况下，1-2个小时即可以死亡，各种消毒剂都能杀死淋球菌。淋球菌主要是侵犯黏膜，可以侵入男性尿道、女性尿道以及宫颈等处，可以在上皮细胞内繁殖，使细胞溶解、破裂、坏死，甚至释放毒素，引起局部的急性炎症，引起充血、水肿、化脓和疼痛等。