幼儿急疹和手足口病的区别主要在以下几点：1、病原学不同，幼儿急疹是人类疱疹病毒6型感染引起的，而手足口病是肠道病毒感染引起的，引起手足口病的肠道病毒有20多种类型。2、临床经过不同，幼儿急疹通常是发烧3-5天后热退出皮疹，而手足口病可能有发烧，也可以不发烧，发烧的程度有高有低。3、皮疹不同，幼儿急疹3-5天出皮疹后通常分布于全身，而手足口病的皮疹通常分布在口腔、手、足、臀部、膝关节等处。4、二者的治疗不同，幼儿急疹主要是对症治疗，而手足口病除了对症治疗之外，可以局部用利巴韦林喷雾剂或者干扰素喷雾剂，喷喉咙皮疹处局部抗病毒治疗。