射精的时候出现疼痛的症状，一般是由于精囊或者是输精管道的病变所引起，比如精囊囊肿、射精管狭窄、精囊炎、精囊结核、精囊结石、精囊肿瘤、附睾炎等疾病。
精囊炎可以分为急性精囊炎和慢性精囊炎，急性精囊炎起病较急，表现为尿频、尿急、尿痛、会阴部疼痛、不适等症状。同时伴有射精的时候出现疼痛的症状和血精的症状，严重的时候会引起发热、寒战等全身症状，而慢性精囊炎主要的症状是血精和尿频、尿急、尿痛等症状。另外精囊周围的病变，比如前列腺炎、前列腺结石、尿道狭窄等疾病，也会引起射精的时候疼痛的症状。