直肠炎灌肠的方法，一般采取的是使用灌肠器进行灌肠。在灌肠之前要嘱咐患者先排空大小便，然后将灌肠器从患者肛门置入直肠，一般的灌肠的液体的量在100mL以下，普通都是50mL左右。在冬季的时候会将灌肠液进行加热处理，防止灌肠液过冷，刺激到患者的直肠。
同时在灌肠之后保持患者的臀高位，尽量让灌肠液在体内多停留一段时间，这样效果会更好，一般情况下在一个小时左右，尽量的保持，如果患者感觉不适，可以到卫生间将灌肠液排出。