脑垂体磁共振检查主要是为了排除脑垂体是否有占位性病变，怀疑脑垂体有病变，一般以生长发育有问题的青少年为主，例如最常见的矮小症患者，或者是乳房发育过早的女性。
这个时候临床医生都会开具脑垂体的磁共振检查，进一步明确垂体内是否有病变，从而排除是否因为脑垂体的实质性病变影响了激素分泌，从而导致疾病的产生，因此脑垂体检查有它的实际意义。