牙根发黑一般是两种情况，具体如下：
第一、外源性染色，比如抽烟的患者或者喝茶的患者，因为长时间的色素会沉积在牙根表面，这时候就会出现牙根上会显得有点发黑的情况。这种可以通过洁治的方法或者喷砂，把牙根表面的色素去掉。当然最好的办法是要戒烟，从来都不建议患者去吸烟，最好的办法是把烟戒掉，适当的喝茶没有问题，但是尽量不要太浓的茶。
第二、根面龋，就是牙根表面发生的龋齿，这种时候也会表现出牙根发黑的情况，可能就要做一些相应的牙体治疗，要把牙根表面的龋齿清除干净，然后进行充填。如果是在牙根的表面，这种时候充填效果会比较差。
具体的诊断或者治疗方式，建议患者还是不要自己的去随便猜，因为很可能猜不准，还是要找医生看，让医生做相应的检查，该拍片子就拍片子，该做相应的检查就做相应的检查，确定一下病因是什么，然后采取相应的治疗方式来进行治疗。