睡醒后抬胳膊肩膀疼可以是以下几种原因引起：
第一、肩关节的疾病，当肩关节有肩袖撕裂或者是肩周炎时，在晚上患侧的肩受到了压迫，而出现睡醒觉之后抬胳膊肩膀疼的症状，这时要检查肩关节的X线片、核磁共振来早期诊断和早期治疗。
第二、肌筋膜炎，肌筋膜炎也可以放射到同侧的肩部以及上肢，出现胳膊、肩膀的酸麻、疼痛、无力的症状，可以在晚上睡觉受压之后出现抬胳膊疼的症状，这时要早期查体和检查，排除其他的疾病来诊断。
第三、颈椎病，当颈椎病严重时可以压迫神经根而导致神经根性的疼痛，在晚上睡觉之后可以导致关节的抬举功能障碍，这时要检查颈椎的X线片、CT、核磁共振来诊断。