血液透析和血液灌流的区别在于，血液透析主要是清除小分子物质，血液灌流主要清除一些比较大分子的物质，包括蛋白结合率比较高的物质，往往用于药物或毒物中毒，此时才会采取血液灌流。
血液透析和血液灌流机制也不一样，血液透析实际上是利用血液透析膜作为半透膜，通过弥散、对流等方式，将体内有害物质吸出体外，达到净化血液目的。血液灌流一般是把血液引入到吸附剂罐子里面，把中大分子毒素都吸附进去。另外，血液灌流主要作用是吸附中大分子毒素，主要用来药物和毒素药物、毒物中毒患者的抢救，血液透析实际上是尿毒症的一种常规维持方法。