雌二醇为女性十分重要的雌激素，雌二醇低可能是因为卵巢疾病引起，当卵巢出现发育异常，例如卵巢有囊肿或者原发性卵巢衰竭，而雌激素主要是卵巢分泌，当卵巢异常时，直接会导致体内的雌激素分泌过少。
一些其他疾病，例如脑垂体、下丘脑以及卵巢轴异常疾病也会导致女性出现闭经的情况或者不孕，此时雌二醇也比较低。另外当女性内分泌失调时，经常也会伴随着月经不调的情况，此时体内的激素水平产生变化，雌二醇会比较低。雌二醇激素水平也受日常情绪、饮食等影响，如果睡眠不好或者精神长期欠佳的情况下，也有可能会导致体内雌二醇激素水平下降。