病毒性咽炎的症状主要是急性的咽喉疼痛，呈放射状，在鼻部、鼻咽部、咽部后方、咽部两侧，甚至双侧的耳部都会产生放射性疼痛。疼痛在安静、吞咽时可以明显的加重，故患者容易因为畏惧咽痛而不愿咽口水或说话。
但是在吃饭的时候，局部的咽痛及放射痛反而较安静时有所减轻。病毒性咽炎还常伴有咽痒、咽部异物感以及堵塞感。如果是儿童，还常伴有病毒性感染的其他全身症状，如乏力、畏寒、消化不良等其他症状。