消化性溃疡的典型症状为上腹痛，性质可有钝痛、灼痛、胀痛、剧痛、饥饿样不适，特点是慢性过程可达数年或十余年，反复或周期性发作，发作期可为数周或数个月，发作有季节性，典型者多在季节变化时发生，如秋冬和冬春之交发病。
部分病人有与进餐相关的节律性上腹痛，餐后痛多见于胃溃疡、饥饿痛或夜间痛，进餐后缓解多见于十二指肠溃疡，腹痛可用抑酸或抗酸剂缓解。部分病例仅表现上腹胀、上腹部不适、厌食、嗳气、反酸等消化不良症状。
还有一类无症状性溃疡，这些病人无腹痛或消化不良症状，而以消化道出血、穿孔等并发症为首发症状，可见于任何年龄，以长期服用非甾体抗炎药病人及老年人多见。