长效青霉素也叫苄星青霉素，长效青霉素的副作用是引起过敏反应，其中以皮疹最多见，还有可能引起白细胞减少、间质性肾炎、哮喘发作和血清病型反应，它最严重的过敏反应是引起过敏性休克。
过敏性休克如果发生会致命，一旦发生必须就地抢救，在用药前一定要询问患者药物过敏史，并进行青霉素的皮肤试验。如果青霉素皮肤试验阳性，禁止注射长效青霉素。如果皮肤试验阴性，可以继续注射长效青霉素。如果有青霉素药物过敏史者，或青霉素皮肤试验阳性的患者应禁止使用此药，对于有哮喘、湿疹、枯草热、荨麻疹等过敏性疾病的患者，应慎重使用此药。