支原体和HPV通常没有直接关系，支原体是一种致病微生物，如果持续感染，可能会造成女性宫颈管黏膜炎，继续上行感染可能会造成输卵管炎，严重者会造成不孕症。而HPV是人乳头瘤病毒，如果是高危的HPV持续感染，可能会造成宫颈癌前病变及宫颈癌，而低危可能会造成外阴或阴道尖锐湿疣，是一种传染性的性病。
HPV和支原体虽然没有直接联系，但两者往往同时存在感染。如果同时存在感染，要及时进行有效的治疗，因为两个疾病可能会互为因果，从而加重感染的症状。所以，给予抗HPV感染的同时，也要给予一些治疗支原体的药物进行针对性的治疗。