肺穿刺当然疼，所以医生在做肺穿的时候都会给别人打麻药，但是这种麻药一般不是全身麻醉的，都是局部麻醉。同时肺穿刺要做一些准备工作，在别人有剧烈咳嗽的时候会避免做肺穿刺，因为剧烈咳嗽的时候非常容易产生气胸的不良反应。总体来讲，肺穿刺虽然是有创性的操作，还是比较安全的，也不用进手术室，在病人的床旁和穿刺室就可以进行。
病人经过局部麻醉，医生正常操作半个小时就可以完成。有的时候肺穿刺会出现胸膜反应，刚进针的时候会头晕，这之前经过充分的麻醉，就不会出现。另外，肺穿刺偶尔会出现气胸，但是气胸在经过治疗也会缓解，所以穿刺相对来说还是比较安全的检查。在打了麻药以后，疼痛症状比较轻微，就跟打针差不多，不存在不能忍受的问题，所以并不痛苦。听起来很吓人，实际上没什么。