肩膀的骨头疼可能有以下几种原因：第一、肿瘤，当骨头有自身的肿瘤，比如骨样骨瘤、纤维瘤或者是骨头转移瘤时，就可以出现肩膀的骨头疼痛，要早期的进行肩膀骨CT的检查，来进行早期的诊断和治疗。第二、感染，当骨头有感染性疾病，比如结核或者是细菌的感染时，就可以出现骨头的疼痛，可以伴有局部的红肿、窦道的形成，要进行血的化验，以及肩膀的X线片、CT、核磁的检查，来进行早期的诊断和早期的治疗。第三、肩峰撞击综合征，也可以出现肩峰以及大结节骨头的疼痛。