早上起来眼睛疼，可能有下面几个原因：1、前一天夜里有用眼过度，然后经过一夜的休息没有完全缓解。这样可以导致眼睛疼。2、可能是眼压高了，也就是青光眼，这个就需要去医院做全面检查，来排除一下有没有青光眼这种疾病，比如查查视力、眼压、眼底、视野等等。如果是青光眼就要及时的治疗，为青光眼这种病对视功能的损害是不可逆的，要早期发现、早期治疗，而且要终生地复查。3、眼睛疼可能是眼睛有一些炎症，比如结膜炎、角膜炎或者麦粒肿，都可以导致眼睛疼，这个就要用一些抗生素的眼药水和眼药膏来治疗。4、可能眼睛里面进了异物，这样也会导致眼睛疼，这个时候要去医院把异物取出来，然后再用一些抗生素的眼药水来防止继发感染。5、可能有眼睑的倒睫或者前一晚戴了隐形眼镜，然后划伤了角膜都可以导致眼睛疼。这个时候可以用一些药来让角膜的损伤恢复，然后防止感染，倒睫可以去医院拔出去。6、有的时候结膜结石也可以磨眼球导致眼睛疼，这个结膜结石实际上是由代谢下来的上皮细胞，还有一些分泌物凝结而成的。如果引起了眼睛的磨痛，也可以去医院在局麻下用针头拨出去，再用一些抗菌素的眼药水来防止感染。