高位肛瘘手术以后完全恢复大概需要两个月左右的时间，高位肛瘘由于内口比较高，肛瘘主管跨越的位置比较长，因此，为避免肛门功能失禁，多采用挂线的方法进行手术治疗，挂线的过程当中为了避免出现勒割过快。
因此，挂线的松紧适当，定期适度的要松紧挂线，这个过程需要较长的时间，大概要需要一个月左右。创面完全恢复以后，局部的瘢痕组织也会比较重，如果要达到彻底的机能恢复，大概需要两个月左右的时间。