男性小便疼痛需要到医院进一步检查明确具体原因。可能的病因有：1、泌尿道急慢性感染，可以出现明显的尿频、尿急伴有排尿疼痛，感染后尿道黏膜上皮充血、水肿，尿液流经相关感染的黏膜后产生刺激性疼痛，需要留取尿常规或者尿培养确诊后抗感染治疗；2、尿道结石，可以产生明显的小便疼痛并且伴有排尿不畅、排尿费力或者肉眼血尿等，建议进行泌尿系统B超排除有无结石，存在结石则要考虑进行碎石或者取石手术治疗；3、泌尿道肿瘤，也可以产生明显疼痛并且伴有尿道出血，可以行尿道镜检查排除有无泌尿系统肿瘤病变。