肛瘘不一定要修剪肉芽，大多的肛瘘手术切口为开放切口，切口在愈合的过程中需要在切口内先使肉芽生长，填满切口以后皮肤愈合，手术切口才算完全愈合。
而有些患者在切口愈合的过程中，肉芽生长过快，高出皮肤表面，这样就会影响切口皮肤的愈合而导致肛瘘切口愈合不良。类似这种情况患者需要在术后及时进行肉芽的修剪，促进手术切口皮肤的愈合。
而肛瘘手术切口肉芽如果没有出现异常增生，并不需要进行修剪，在临床上大多肛瘘术后的患者也不需要进行肉芽的修剪。