缺氧对机体的影响与缺氧的严重程度有密切关系，轻度的缺氧可以表现为呼吸系统的代偿反应，可以出现呼吸的加深加快，有利于肺泡通气量增加，有利于肺从外界摄取更多的氧气，从而纠正低氧血症。另外患者的呼吸频率增加，呼吸幅度增加，胸腔内的负压均会增加，会促进静脉回流，从而使心脏的射血增加，有利于对氧气的摄取和输送。
但是对于严重的缺氧，机体会出现失代偿反应，出现呼吸中枢的抑制，导致呼吸频率变慢、呼吸变浅，同时节律异常，甚至会出现呼吸停止。另外，患者出现的长期慢性缺氧，患者肺血管的病理改变，肺血管收缩会导致肺动脉高压形成，长期以后会形成慢性肺源性心脏病。