甲状腺球蛋白偏低可以见于甲状腺发育不全，以及先天性甲状腺缺损、甲状腺损伤。甲状腺球蛋白是甲状腺滤泡上皮细胞分泌的大分子糖蛋白，绝大多数由甲状腺细胞合成，并释放进入甲状腺滤泡的残腔中。
促甲状腺激素、甲状腺体内碘缺乏和甲状腺刺激性免疫球蛋白，可以刺激其产生。甲状腺球蛋白的浓度主要由三个因素决定，已有的甲状腺分化组织大小、甲状腺损伤程度，比如外伤、炎症，以及激素的影响，主要是TSH、绒毛膜促性腺激素、TSH受体抗体。