新冠肺炎检测原理是以特定病毒基因为靶标，通过PCR扩增，核酸使靶标DNA序列指数级增加，扩增出来的DNA序列与荧光标记探针结合，产生荧光信号，而没有病毒的样本中就检测不到荧光信号增强。所以，核酸检测其实是通过检测荧光信号的累积，来确定标本中是否有病毒核酸。
病毒核酸检测是通过特殊技术检查标本中的核酸，确定病毒种类，这是临床上非常常用的检测方法，为临床诊断和治疗提供帮助。
通过采集患者的咽、鼻等呼吸道分泌物，粪便、尿及纤支镜取出的下呼吸道分泌物等作为标本，检测其中是否存在某一特定病毒的病原体核酸。